다른 관점에서 한 번 생각해봅니다.
- 권리의 행사와 의무의 이행은 신의에 좇아 성실히 이행하여야 합니다. (신의성실의 원칙) 물론 신의칙 법이론이 실질적으로 적용되는건 조금 다른 이야기이지만 어쨌든 상호 계약관계에 있어서 신의칙은 지켜져야 합니다.
- 계약의 내용이 A를 사용하든 B를 사용하든 무관하게 최종산출물을 내놓는 거라면, 상대 업체(이하 Y사)의 행위는 원가를 절감하는(?)데 있어 지극히 당연한 부분이고 뭐라고 할 수 없는 부분입니다.
- 그러나 계약의 내용이 (이유여하를 막론하고) A를 사용하기로 되었다면 적어도 해당 업체는 이를 지켜야 하고, 만약 B로 바꾸고자 한다면 계약서를 변경하거나 적어도 똘빼님의 회사 (이하 X사)와 구두 합의하거나 구두 통지가 있어야 할 것입니다.
- 나아가, 좀 더 신의있는 계약관계를 이어나가고자 하는 회사였다면, "A를 쓰는 것 보다 B를 쓰는 것이 최종적으로 품질은 동일하고 가격은 저렴하니, 단가가 얼마간 줄어듭니다. 그러니 B로 바꾸시는게 어떻겠습니까?" 라고 물어보는게 보다 바람직했을 거라고 생각됩니다. 이로 인해 B사가 볼 이익이 조금은 줄어들 수 있겠지만, A->B 변경으로 인한 전체 이익이 3천이라고 가정했을 때, X사에게 청구금액을 천 만원 줄여주면, X사도 좋고 Y사도 2천의 이득은 어쨌든 더 생기는 상황입니다.
- Y사의 행위는 계약을 성실히 이행하지 않았고 (채무불이행), 파트너십의 도의도 다소 저버린게 아닌가 합니다. 점검해보신 결과 A와 B를 각각 썼을 때의 최종 산출물에 차이는 없다고 하셨지만, 어쨌든 그 차이에서 오는 리스크는 존재할 확률이 있고, 그 리스크를 X사가 온전히 떠안는 것은 불공정해보입니다.
- 따라서 Y사에 채무불이행 책임을 물어도 잘못된 것은 아니나, 다만 이는 권리남용에 해당할 수 있으므로 (X사에겐 무관하나 Y사 만을 괴롭히는 행위가 될 수 있으므로) 채무불이행 책임을 지우는 대신 A->B로의 변경에 따른 단가차이에서 오는 일정 금액을 환불해달라고 요구하는 것은, 잘못된 행위는 아닐 것이라고 생각됩니다.

전 표면의 현상 밑에 있는 보이지 않는 것들이 '진짜로 쌓이는 것'이라고 믿는 편인데요. 이게 무슨 말이냐면...
'일을 열심히 한다'는 현상을 들여다 보면 '마지못해서 한다' '책임감 때문에 한다' '재미있어서 한다' '주어진 일은 그냥 하는 성향이다' 등등... 여러 가지 요소가 있을 수 있는데, 이 중 어떤 것이 축적되느냐가 진짜 차이를 만든다고 생각합니다. 마지 못해서 열심을 내는 게 쌓이는 것과, 재미있어서 열심을 내는 건, 지금 당장은 둘 다 똑같이 열심히 하는 거라도 나중에 유의미한 차이가 있을 거라는 겁니다. 마지 못해서 열심히 하다가 도저히 못 견디겠어서 직종을 바꾼다든지... 재미있어서 열심히 하다가 아예 똘빼님처럼 대표가 될 수도 있고요...

그런 관점에서 지금 이 고민을 보면
1. 현상 : 그들이 약속을 어겼다 / 돈 천만원의 이익을 발생시킬 수 있다....
2. 기저 : ?
3. 기저에 깔린 요소가 축적되었을 때 난 무엇을 기대하는가? : 다신 그 업체가 똑같은 실수를 저지르지 않는 거(?), 안정된 파트너십(?), 수익 극대화 등등..
입니다.

즉 저 2번 물음표를 해결하시는 게 고민이신 건데.. 답은 3번에 있죠. 이건 제가 잘 모르겠어요.
지금 당장 돈 천만원이 필요하신 게 3번의 답이라면 2번에 '모든 발생 가능한 수익을 다 취한다'를 넣을 수 있다는 뜻입니다.
그러나 그 업체와 계속 일을 하실 계획이고, 그래서 그냥 이런 약속 어김이 다시는 일어나지 않는 게 더 큰 목적이시라면 '따끔히 혼내주는 게' 2번의 답이 되겠죠.
후자의 경우라면 돈 천만원을 위에서처럼 '따끔한 경고'로서 취하실 수 있겠고, 새로운 계약서를 쓰신다든지, 강력하게 클레임을 거신다든지... 업체와의 관계에 따라 여러 가지 방법을 쓰실 수 있을 겁니다. (제가 대표가 아니라 더 많은 '구체적인' 방법을 제시하지는 못하겠네요 ㅎㅎ)

요는 이러한 일들을 처리할 때 '현상의 해결'이 아니라 보이지 않는 뭔가가 똘빼님 안에 쌓이는 것을 경계해야 한다는 겁니다.
돈 천만원을 취하기로 결정하신다고 하더라도, '돈 천만원이 아쉬워서' '단기적인 수익은 모두 취하기 위해' '약속을 어긴 것에 대한 경고로서' '장기적인 파트서십을 위해' 등등 보이지 않는 다양한 요소들 중 무엇을 내 안에 축적시킬 것인가를 돌아보셔야 합니다.

이번 건을 '모든 수익을 취한다'는 관점에서 천만원을 받아내시면.. 똘빼님은 '모든 기회에서 최대한의 수익을 취하는 성향'에 조금 더 가까워지시겠고
'약속을 다신 못 어기게 하기 위해'라는 관점에서 천만원을 받아내시면... 똘빼님 자신도 약속을 절대 안 어기는 성향에 조금 더 가까워지실 수 있겠고...(이를테면)
.. 머 그런거죠. 더 다양한 경우의 수가 있을 겁니다만, 제가 해당 현장을 몰라서... ㅜㅜ

즉 천만원을 뜯자 말자.. 이것보다 내가 정말 이 사건으로부터 얻고자 하는 게 무엇인지를 분석해보심이 어떠실까요.
모든 사건은 현상에 불과합니다. 그 기저에 깔린 보이지 않는 뭔가가 약속을 어긴 상대 업체는 둘째치고 '나를' 자꾸만 만들어가요.
이번에 주어진 사건 속에서 난 어떤 재료를 가지고 나를 만들어갈 것인가... 그게 선결되어야, 그 수단으로서 천만원의 행방이 자연스레 결정될 것 같네요.

물론.. 제 개인적인 의견입니다.

최종적으로 제품의 질에 대한 차이가 정말 없는지가 확인 되었다면,
글쓴님에게 어떤 손해는 없지만, 이는 명백한 계약위반입니다.
저도 십여년 회사 생활을 하고 있는데, 많이 느끼는 말, 두려워하는 말이 하나 있습니다.

'안좋은 선례를 남기면 그 후폭풍은 생각 이상으로 크다.'

지금 당장의 문제가 아닐수도 있습니다.

이 계약 위반 부분을 금전적으로 되돌려 받지 않는다고 하더라도,
계약위반이 있었지만, 되돌릴 타이밍이 늦었다고 판단하여 이러이러한 조치를 했다.
하지만, 두번째도 이런 경우가 있다면, 이번 계약건에 대한 것도 되물을 것이다. 등의 기록은 상호확인하고 남기는게 좋겠죠.

호이가 계속되면 둘리인지 아는 사람은 주변에 생각보다 많습니다.