제가 해당 분야 전문가도 아니고 저서에서 신체적이란 용어를 어떻게 사용한 지는 모르겠지만, 3일, 주어진 문제 등의 어휘 선택으로 볼 때 저자의 진술은 이렇게 해설 가능할 것 같습니다.

누군가에게 낯선 분야의 문제를 해결해야 하는 상황이 닥쳤을 때, 그는 안개 속에서 출발하는 셈이므로 인지적 부하로 인해 고통을 받을 수 있다. 그러나 해당 분야에 대한 약 삼일 간의 노출 뒤에는 그 나름의 인지적 틀을 갖추게 되고 비교적 적은 노력으로 기존의 사고 과정을 적용하며 문제를 다룰 수 있게 되므로, 첫째론 인지부하에서 오는 고통의 해소가 선행할 것이고 둘째로 그 실질적 해결 과정에서 즐거움을 느낄만도 할 것이다.

이런 방향의 서술이었다면 다음 해설도 그럴듯하게 보입니다.

기존에 스스로에게 익숙한 분야의 문제였다면 3일의 시간도 필요없이 즉각적으로 몰입하여 즐거움을 느낄 수 있을 것이고, 반대로 익숙하지 않으나 인지적 부하나 문제의식에서 오는 압박이 적었다면 3일 후에도 고통의 해소에서 오는 변화된 상황을 체감하기가 어려울 수 있다. 즉 문제 해결보다 삼 일 간의 집중 그 자체가 목적이었다면 고통도 압박도 없었을 것이므로 해소도 즐거움도 적을 것이다.

어찌되었건 원 서술에서의 '신체적'이란 용어사용은 인지부하로 인한 스트레스의 해소에 근원이 있지 않을까 합니다.

아 그런 입장이시라면, 간단히 답변 드리면:
1. 황농문씨는 칙센트미하이가 주장하는 '몰입' 연구에 기반하여, 자신의 경험을 덧붙여 그냥 수필을 쓴 것입니다. 과학적 연구를 한 것도 아니고, 황농문씨가 그렇게 주장하지도 않았기에, 당연히 황농문씨의 몰입에 대한 '생각'에 대한 반박도 없습니다.
2. 다만 칙센트미하이를 필두로 한 심리학자들은 몰입에 대해 엄청나게 많은 과학적인 연구를 했고, 지금도 많은 연구가 이뤄지고 있습니다. 그 내용을 비전공자들도 알아듣기 쉽게 쓴 책이 글쓴이가 읽으신 '몰입' 책이고요. 칙센트미하이씨가 '3일간 몰입하면 깨달음이 올것이다'라는 주장을 하진 않습니다. '어떤 특성을 가진 과제에 어떤 자세를 가진 사람들이 어떤 행동을 하면 '몰입'을 하게 되는데, 그 '몰입'을 하면 어떤 경험들을 하게 되고, 어떤 결과 (예: 창의적인 생각)를 낳게 된다.'정도의 주장을 하죠. 위의 댓글에도 달았듯이, 심리학 자체가 특정 개인에게 조언을 주려고 하는 연구가 아니라, 일반적인 현상에 대해 연구하기 때문이죠.
(https://www.ted.com/talks/mihaly_csikszentmihalyi_on_flow?language=ko) 책의 내용과 거의 겹치겠지만, 칙센트미하이가 테드 강연한 영상입니다. 한글 자막이 잘 달려있네요.
3. 다만 읽으신 칙센트미하이의 '몰입'책도 10년 이상된 옛 연구를 기반으로 쓰여진 것이기에, 최근 연구상황을 반영하진 않습니다.
4. 최신 연구 상황을 한국어로 잘 번역한 자료는 제가 알기론 없습니다. 몰입에 대한 최근 주장들과 반박들은 아쉽지만 영어 원문을 볼수 밖에 없습니다. 구글 스칼라가 관련 자료 찾기는 좋죠.
(https://scholar.google.com/scholar?hl=en&as_sdt=0%2C26&q=mihaly+csikszentmihalyi+flow&btnG=&oq=mihaly+)
5. 저도 최근 몰입 연구를 열심히 따라보진 않고 있어서 더이상의 답변은 못 드리겠네요.

여튼 독서하시고, 실천까지 하신 점 놀랍습니다!